马林为帮助中国共产党人建党作出了重大贡献。此后他又为中国共产党制定国共合作、建立统一战线的战略，在推动两党合作方面作出了巨大贡献。1921年12月，马林在中共党员张太雷陪同下去桂林，三次会见孙中山，向孙中山提出了许多重要建议。
1924年初，马林回到莫斯科，由于与共产国际方面的工作意见不一致，他向共产国际辞职，回到祖国参加荷兰共产党的工作。
马林虽已远离中国，仍非常关心中国的命运。他在离开中国后多次从有关方面了解中国革命的情况，向中国朋友谈到他对中国革命的看法和意见，鼓励中国共产党人继续奋斗。
1926年，斯大林在共产国际以及联共（布）开展反对托洛斯基反对派的斗争。马林站在托洛斯基一边。这样，他无法再在荷兰共产党内立足，于1927年宣布退出。
1929年，马林在荷兰建立了托派组织“革命社会党”，并以“革命社会党”代表身份参加荷兰国会。但是，1938年当托洛斯基组织第四国际时，马林拒绝参加。
根据党史专家李玉贞、杨云若等在荷兰查阅的马林档案得知，他于1942年被德国法西斯枪杀。大致情况如下：
1940年，德国法西斯侵吞了荷兰，马林投身于反法西斯的正义斗争之中。他编辑了秘密发行的报纸《斯巴达克》，鼓励荷兰人民奋起反抗侵略者。
1942年3月6日，马林被德国法西斯抓捕。他自知来日无多，于4月11日给女儿、女婿写下了充满亲情而又壮烈感人的遗嘱：
永别了，我的女儿，我的宝宝——永别了，我亲爱的人！
孩子们，我无疑真诚地愿为我的理想献身。谁知骤然间死神将至，不可逆转。但我心中坦然——多年来我始终是一个忠诚的战士。告发我的人和法官们无不承认我死得光明磊落。这使我非常感动，因为人们都已十分了解我至死不渝、矢信矢忠，殚精竭虑，高举我信仰的旗帜，奋斗到最后一息……
直至弥留之际，我都希望如马来亚格言所云：见义勇为。你们要互敬互爱。最后一次热烈地吻你们。
关于马林之死，当年一位幸存下来的与之同狱的难友——普雷特尔，1945年在荷兰《火炬》周刊上发表回忆文章，记述了他目击的悲壮一幕：
4月12日晚上9点钟，马林等七个反法西斯战士被关进普雷特尔周围七间空着的牢房里。牢房之间，只要大声说话，隔壁的人就可以听到。所以他听到一个叫斯内夫利特的人说：“我们应当感到自豪。我们是荷兰第一批为国际事业而被法院判刑的人。我们必须为国际事业而牺牲。”
第二天早晨6点钟左右，德国法西斯准备对这七人执行死刑。斯内夫利特要求七个人手拉手一起受刑。遭到拒绝后他又要求被枪毙时不戴遮眼布。斯内夫利特对他的六个战友说：“我青年时代参加运动的时候，我的神父对我说：如果你坚持你的信仰，小伙子，你就大着胆子向前走吧！我确实进行了斗争，而且一直坚持我的信仰，恪守我的信念，相信国际的事业。未来是属于我们的。”然后他提议，“让我们举起手来，唱《国际歌》。”于是，七个人一直唱起了《国际歌》。豪壮的旋律，感人的歌词在牢房中回荡。
稍后，他们被装进一辆汽车。9时20分，普雷特尔听到了一阵枪响……
就这样，马林倒在德国法西斯的枪口之下，终年53岁。
